기업부설연구소 설립부터 사후관리까지, 모든것 알아보기

매년 4월이면 기업부설연구소와 연구개발전담부서의 연구개발 활동을 점검하는 연구개발활동조사가 진행됩니다. 이 조사 결과는 연구소의 유지 여부에도 영향을 미치기 때문에 사전 준비가 중요합니다.
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Mar 06, 2025
기업부설연구소 설립부터 사후관리까지, 모든것 알아보기

매년 4월이면 기업부설연구소와 연구개발전담부서의 연구개발 활동을 점검하는 연구개발활동조사가 진행됩니다. 이 조사 결과는 연구소의 유지 여부에도 영향을 미치기 때문에 사전 준비가 중요합니다.

그렇다면 기업부설연구소를 설립하고 유지하는 데 필수적으로 고려해야 할 사항은 무엇일까요? 지금부터 하나씩 알아보겠습니다.


기업부설연구소/연구개발전담부서 인정제도란?

기업부설연구소·연구개발전담부서 인정제도란?

연구개발 활동을 촉진하기 위해 일정 요건을 갖춘 연구소를 신고하도록 하고, 인정된 연구소에 대해 조세, 자금, 인력 등의 지원 혜택을 제공하는 제도입니다.

신고 대상

  • 과학기술 및 서비스 분야 연구개발 활동을 수행하는 기업(개인기업 포함)

  • 비영리기관, 의료법에 따른 의료법인 등은 제외

  • 담당 기관: 한국산업기술진흥협회(KOITA)


기업부설연구소 인정 조건

기업부설연구소로 인정받기 위해서는 인적 요건과 물적 요건을 모두 충족해야 합니다.

① 인적 요건

  • 연구전담요원 수: 기업 규모에 따라 최소 2명~10명 이상

  • 연구전담요원의 자격:

    • 자연계(자연과학, 공학, 의학계열) 학사 이상

    • 국가자격법에 따른 기술·기능 분야 기사 이상

📌 단, 산업디자인 및 서비스 분야 연구소는 비자연계 학위도 인정됩니다.

② 물적 요건

  • 연구소는 독립적인 연구 공간을 확보해야 합니다.

  • 사방이 벽체로 구분된 별도의 출입문이 있는 독립 공간이 필수입니다.

  • 연구 기자재와 연구원이 연구개발을 수행할 수 있을 만큼 충분한 면적을 확보해야 합니다.

📌 단, 중소기업·벤처기업의 경우 50㎡ 이하의 공간이라면 칸막이로 구분하여 운영 가능합니다.

기업부설연구소 설립 신고는 선설립·후신고 방식으로 진행됩니다. 준비가 끝나면 기업부설연구소/전담부서 신고관리시스템을 통해 신고할 수 있습니다.


기업부설연구소 세제 및 관세 지원 혜택

기업부설연구소로 인정받으면 다양한 세제·관세 혜택을 받을 수 있습니다.

1. 조세 지원

  • 일반 연구·인력개발비 세액공제 (조세특례제한법 제10조)

  • 기업부설연구소용 부동산 지방세 감면 (지방세특례제한법 제46조 제1항)

  • 연구전담요원의 연구활동비 소득세 비과세 (소득세법 시행령 제12조 제12호 다목)

2. 관세 지원

  • 연구개발 물품 관세 감면 (관세법 제90조)

📌 기업 입장에서 세제 혜택은 연구개발 비용 절감 효과를 가져오기 때문에, 기업부설연구소를 운영하는 가장 큰 장점 중 하나라고 할 수 있습니다.


기업부설연구소, 사후관리가 더 중요합니다!

기업부설연구소는 설립보다 유지가 더 중요합니다. 신고한 기업은 연구소 요건을 지속적으로 충족해야 하며, 다음과 같은 의무를 준수해야 합니다.

① 변경신고 의무

  • 기업부설연구소의 정보가 바뀌면 30일 이내 변경 신고해야 합니다.

  • 변경 신고는 기업부설연구소/전담부서 신고관리시스템에서 가능합니다.

② 실적보고 의무

  • 매년 4월 연구개발활동조사에 연구개발 실적을 보고해야 합니다.

  • 미제출 시 기업부설연구소 인정이 취소될 수 있습니다.

③ 사후관리 및 현지 조사

  • 한국산업기술진흥협회는 연구개발 활동 및 요건 충족 여부를 수시로 조사합니다.

  • 서류 증빙 필수! 연구개발활동 증빙자료(연구노트, 사업계획서, 결과보고서), 연구전담요원의 학위증명서, 국민연금·건강보험 납부내역서 등은 항상 구비해야 합니다.

  • 사후관리 의무 불이행, 인정 요건 미달 시 인정 취소 조치가 내려질 수 있습니다.

  • 특히 허위 신고나 부정한 방법으로 인정받은 경우 1년간 신고가 제한됩니다.


R&D 정부과제 진행 시 연구노트 작성이 필수입니다!

기업부설연구소를 운영한다면 연구노트 관리도 중요합니다. 연구개발 실적을 증명하기 위해서는 연구노트가 필수적이기 때문입니다.

기업부설연구소를 통한 정부 지원 및 세액공제 혜택 확보

연구개발비 세액공제 증빙 필수 자료

  • 기업부설연구소가 인정받으면 연구개발비에 대한 세액공제 혜택을 받을 수 있는데, 연구노트가 그 증빙 자료로 활용됩니다.

  • 조세특례제한법 제10조에 따라 연구·인력개발비 세액공제를 신청하려면 연구개발 활동을 입증해야 하는데, 연구노트는 필수 제출 서류 중 하나입니다.

R&D 정부 과제 지원 및 사후 정산 필수 요소

  • 연구노트는 정부 R&D 과제 수행 중 연구 개발 과정을 증명하는 공식 기록입니다.

  • 연구개발비 지원을 받았을 경우, 정부 기관에서는 연구개발이 실제로 이루어졌는지 검토하는데, 이때 연구노트가 핵심 증빙 자료가 됩니다.

  • 연구노트가 없거나 부실하게 기록된 경우, 정부 과제 정산 과정에서 연구비를 환수당할 위험이 있습니다.

기업부설연구소 운영을 고려하고 계신다면, 설립부터 사후관리까지 철저하게 준비해야 한다는 점을 꼭 기억하시기 바랍니다!

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